El 27 de abril de 2018 fichó por el Atlético Mineiro con el que firmó un contrato por cinco temporadas. El 31 de enero de 2019, el Atlético Mineiro anunció el traspaso de Emerson al Real Betis Balompié, camiseta del barcelona en una operación conjunta con el Fútbol Club Barcelona. Su estancia en Barcelona fue breve ya que el 31 de agosto de 2021 fue traspasado al Tottenham Hotspur F. C. a cambio de 25 camiseta fc barcelona millones de euros.
