El club también cuenta con sección de balonmano, sección que fue creada en agosto de 1945. Tras el final de la Segunda Guerra Mundial, los exjugadores de balonmano del Turnerschaft Jahn München Otto Wurth, Erwin Rudolf Kienzl y Vincenc, comenzaron la conformación de un departamento de balonmano. Durante los años 1970 continuó el imparable aumento de socios del club: se pasó de los 55 000 a los 80 000. Fueron los años en los que el fútbol español abrió las puertas a los jugadores extranjeros y el club fichó a internacionales como Johan Cruyff, Johan Neeskens, Hugo Sotil, Hansi Krankl y Allan Simonsen.
